ESmol -- molecular viewer APP
注意!
如果您的设备可以运行NDKmol,请使用它。这是更快,
比ESmol更多的功能。
您可以从https://play.google.com/store/apps/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol得到NDKmol。
ESmol维持兼容很老的设备。
== ==简介
ESmol是Android分子观众。
可以查看蛋白质,核酸和小分子的三维结构。 ESmol支持大多数为分子共同表示,例如带,迹线,棒,球和线。 ESmol还支持对称操作;可以显示生物组件和晶体堆积。您可以搜索和下载RCSB从PDB和NCBI PubChem数据库结构。
ESmol几乎相同的功能GLmol,这是写在
WebGL的/ Javascript和在Web浏览器运行。您可以在http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html尝试GLmol
== ==特点
*阅读PDB文件
(ESmol无法打开大分子(3MB比多)。为此,请在http://market.android.com/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol使用NDKmol)
*读取SDF / MOL文件
*搜索和下载RCSB从PDB和NCBI PubChem数据库结构
*旋转/翻译通过手指/缩放模型
*交涉
- 线路
- 棒
- 球(范德华半径)
- 阿尔法碳跟踪
- 织带
- 斯特兰德
- B因子管
- 核酸梯
- 核酸线
- 溶剂“明星”
*着色
- 通过链
- 从二级结构(在SHEET / HELIX记录时定义的)
- 通过元素
- 等级(a.k.a chainbow)
- B因素
- 极性/非极性
*晶体
- 显示单元电池
- 显示晶体堆积(当在REMARK部分中所定义)
- 显示生物组件(当在REMARK部分中所定义)
==如何使用==
当启动时,ESmol自动加载脱氧血红蛋白(PDBID:4HHB)为例。你可以通过你的手指旋转分子。
要放大或翻译成您的手机/平板电脑的分子,按MENU按钮,然后选择模式。双指手势也支持。
要加载其他的PDB文件,请把文件中的SD卡的“PDB”目录,并在菜单中选择“打开”命令。您也可以从RCSB PDB和NCBI PubChem数据库Web服务器下载结构直接。选择“搜索和下载”菜单。
== ==联系
项目网站位于http://webglmol.sourceforge.jp/。您还可以得到源代码。
意见和建议,欢迎在http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/或biochem_fan@users.sourceforge.jp
===许可通知===
ESmol本身是在GNU宽通用公共许可证如下许可。
然而,PDB文件包括作为例子是在不同条件下。
请咨询
http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html
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ESmol - 分子浏览器Android版
(C)版权所有2011年,biochem_fan
这个程序是免费软件:您可以重新分配和/或修改
它根据GNU宽通用公共许可证的条款通过公布
自由软件基金会,无论是牌照的第3版,或
(由你选择)任何更新的版本。
这个程序是分布式的希望,这将是有用的,
但没有任何担保;甚至没有的暗示的保证
适销性或适用于特定用途。查看
GNU宽通用公共许可证的更多细节。
您应该已经收到了GNU宽通用公共许可证的副本。
随着这一计划。如果不是,见。