ESmol -- molecular viewer

ESmol - Молекулярный просмотр для Android

ВНИМАНИЕ!

Если устройство может работать NDKmol, пожалуйста, используйте его. Это намного быстрее и
имеют больше возможностей, чем ESmol.
Вы можете получить NDKmol от https://play.google.com/store/apps/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol.

ESmol поддерживается для совместимости с очень старыми устройствами.

== О ==

ESmol представляет собой молекулярный просмотрщик для Android.

Вы можете просматривать трехмерные структуры белков, нуклеиновых кислот и малых молекул. ESmol поддерживает большинство распространенных представлений для молекул, такие как ленты, след, палки, сфера и линия. ESmol также поддерживает операцию симметрии; могут быть отображены биологические узлы и кристаллическая упаковка. Вы можете искать и загружать структуры из RCSB PDB и NCBI PubChem.

ESmol имеет почти такую ​​же функциональность как GLmol, который написан в
WebGL / Javascript и работает на веб-браузеров. Вы можете попробовать GLmol в http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Особенности ==

* Прочитайте PDB файл
   (ESmol не может открывать крупные молекулы (более 3 МБ). Для этого, пожалуйста, используйте NDKmol в http://market.android.com/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol)
* Чтение SDF файла / MOL
* Поиск и скачать структуры из RCSB PDB и NCBI PubChem
* Поворот / Преобразовать / модель масштабирования с помощью пальца
* Представление
    - Линия
    - Придерживаться
    - Сфера (ван-дер-Ваальса радиус)
    - Альфа углерода след
    - Лента
    - Strand
    - фактор В трубке
    - лестница Нуклеиновые кислоты
    - Нуклеиновые кислоты линия
    - растворитель «звезды»
* Окрашивание
    - По цепочке
    - По вторичной структуре (если она определена в ЛИСТ / HELIX записей)
    - По элементам
    - Градация (a.k.a chainbow)
    - фактор В
    - полярный / неполярный
* кристаллография
    - дисплейный блок ячейки
    - Показать кристалл упаковки (если она определена в замечании разделе)
    - Отображение биологической сборки (если она определена в замечании разделе)

== Как использовать ==

При запуске ESmol автоматически загружает deoxyhaemoglobin (PDBID: 4HHB) в качестве примера. Вы можете вращать молекулу вашего пальца.
 
Для увеличения или перевести кнопку молекулы, нажмите кнопку MENU в телефоне / планшете и выберите режим. Два пальца жесты также поддерживаются.

Чтобы загрузить другие файлы PDB, пожалуйста, поместите файл в папке «PDB» на SD-карте и выберите «Открыть» команду в меню. Вы также можете загрузить структуры непосредственно из RCSB PDB и веб-сервер NCBI PubChem. Выберите «Поиск и загрузка» в меню.

== Контактная ==

Сайт проекта находится по адресу http://webglmol.sourceforge.jp/. Вы также можете получить исходные коды.

Комментарии и предложения приветствуются на http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ или biochem_fan@users.sourceforge.jp

=== ЛИЦЕНЗИИ уведомление ===

Сам ESmol распространяется под лицензией GNU Lesser General Public License следующим образом.

Тем не менее, PDB файлы, включенные в качестве примеров в различных условиях.
Пожалуйста, обратитесь к
http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

----

ESmol - Молекулярный просмотр для Android

     (C) Copyright 2011, biochem_fan

     Эта программа является свободным программным обеспечением: вы можете распространять и / или изменять
     это в соответствии с условиями GNU Lesser General Public License, опубликованной
     Фонд Свободного Программного Обеспечения, либо версии 3 Лицензии, или
     (По вашему выбору) любой более поздней версии.

     Эта программа распространяется в надежде, что это будет полезно,
     но БЕЗ КАКИХ-ЛИБО ГАРАНТИЙ; даже без подразумеваемых гарантий
     Или ПРИГОДНОСТИ ДЛЯ КОНКРЕТНОЙ ЦЕЛИ. См
     GNU Lesser General Public License для более подробной информации.

     Вы должны были получить копию GNU Lesser General Public License
     наряду с этой программой. Если нет, то смотрите .