ESmol -- molecular viewer APP
ĐỂ Ý!
Nếu thiết bị của bạn có thể chạy NDKmol, hãy sử dụng nó. Nó là nhanh hơn nhiều và
có nhiều tính năng hơn ESmol.
Bạn có thể nhận NDKmol từ https://play.google.com/store/apps/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol.
ESmol được duy trì để tương thích với các thiết bị rất cũ.
== Về ==
ESmol là một người xem phân tử dành cho Android.
Bạn có thể xem cấu trúc ba chiều của protein, axit nucleic và các phân tử nhỏ. ESmol hỗ trợ hầu hết các cơ quan đại diện chung cho các phân tử, chẳng hạn như băng, dấu vết, gậy, cầu và đường. ESmol cũng hỗ trợ các hoạt động đối xứng; hội sinh học và đóng gói tinh thể có thể được hiển thị. Bạn có thể tìm kiếm và tải về các cấu trúc từ RCSB PDB và NCBI PubChem.
ESmol hầu như cùng một chức năng như GLmol, được viết bằng
WebGL / Javascript và chạy trên các trình duyệt Web. Bạn có thể thử GLmol tại http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html
== Tính năng ==
* Đọc tập tin PDB
(ESmol không thể mở các phân tử lớn (hơn 3MB). Với mục đích này, hãy sử dụng NDKmol tại http://market.android.com/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol)
* Đọc SDF / file MOL
* Tìm kiếm và Tải về cấu trúc từ RCSB PDB và NCBI PubChem
* Xoay / Dịch / Zoom mô hình bằng ngón tay
* Cơ quan đại diện
- Hàng
- Gậy
- Sphere (van der Waals bán kính)
- Alpha dấu vết carbon
- Ribbon
- Strand
- ống tố B
- thang axit nucleic
- dòng axit nucleic
- dung môi 'sao'
* Coloring
- Bằng chuỗi
- Bằng cách cấu trúc thứ cấp (khi xác định trong hồ sơ BẢNG / HELIX)
- Bằng Elements
- Phân cấp (còn được gọi chainbow)
- Yếu tố B
- cực / không cực
* Tinh thể học
- tế bào đơn vị hiển thị
- Hiển thị tinh thể đóng gói (khi định nghĩa trong phần REMARK)
- Hiển thị lắp ráp sinh học (khi định nghĩa trong phần REMARK)
== Làm thế nào để sử dụng ==
Khi ra mắt, ESmol tự động tải deoxyhaemoglobin (PDBID: 4HHB) làm ví dụ. Bạn có thể xoay phân tử bằng ngón tay của bạn.
Để phóng to hoặc dịch phân tử, nhấn nút MENU trên điện thoại / máy tính bảng và chọn chế độ. cử chỉ hai ngón tay cũng được hỗ trợ.
Để tải file PDB khác, vui lòng đặt các tập tin trong "PDB" thư mục của thẻ SD và chọn "Open" lệnh trong MENU. Bạn cũng có thể tải về các cấu trúc trực tiếp từ RCSB PDB và máy chủ web NCBI PubChem. Chọn "Tìm kiếm và Download" trong menu.
== Liên ==
website của dự án tọa lạc tại http://webglmol.sourceforge.jp/. Bạn cũng có thể nhận được mã nguồn.
Ý kiến đóng góp đều được chào đón tại http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ hoặc biochem_fan@users.sourceforge.jp
=== thông báo PHÉP ===
ESmol bản thân được cấp phép theo Giấy phép Công cộng GNU Hạn chế như sau.
Tuy nhiên, các file PDB bao gồm như là ví dụ là trong điều kiện KHÁC NHAU.
Vui lòng tư vấn
http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html
----
ESmol - Molecular Viewer cho Android
(C) Bản quyền năm 2011, biochem_fan
Chương trình này là một phần mềm miễn phí: bạn có thể phát hành lại nó và / hoặc sửa đổi
nó theo các điều khoản của Lesser General Public License GNU như được xuất bản bởi
các Free Software Foundation, một trong hai phiên bản 3 của Giấy phép, hoặc
(Tùy theo lựa chọn của bạn) bất kỳ phiên bản sau này.
Chương trình này được phân phối với hy vọng rằng nó sẽ hữu ích,
nhưng KHÔNG CÓ BẢO HÀNH; thậm chí không có bảo đảm ngụ ý
BÁN hoặc PHÙ HỢP CHO MỘT MỤC ĐÍCH CỤ THỂ. Xem
Giấy phép Công cộng GNU Hạn chế để biết thêm chi tiết.
Bạn sẽ nhận được một bản sao của Lesser GNU Public License chung
cùng với chương trình này. Nếu không, xem .