ESmol -- molecular viewer

ESmol - Visualizador Molecular para Android

AVISO PRÉVIO!

Se o dispositivo pode executar NDKmol, por favor use. É muito mais rápido e
tem mais recursos do que ESmol.
Você pode obter NDKmol de https://play.google.com/store/apps/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol.

ESmol é mantido para compatibilidade com dispositivos muito antigos.

== Sobre ==

ESmol é um visualizador molecular para Android.

É possível ver as estruturas tridimensionais de proteínas, ácidos nucleicos e moléculas pequenas. ESmol suporta a maioria das representações comuns de moléculas, tais como a fita, de rastreio, vara, esfera e linha. ESmol também suporta operações de simetria; montagens biológicas e empacotamento cristalino pode ser exibida. Você pode pesquisar e baixar estruturas de RCSB PDB e NCBI PubChem.

ESmol tem quase mesma funcionalidade que GLmol, que é escrito em
WebGL / Javascript e roda em navegadores da Web. Você pode tentar GLmol em http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Características ==

* Arquivo PDB Leia
   (ESmol não pode abrir moléculas grandes (mais de 3 MB). Para isso, utilize o NDKmol em http://market.android.com/details?id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol)
* Leia SDF / arquivo MOL
* busca e download estruturas de RCSB PDB e NCBI PubChem
* Girar / Traduzir modelo / Zoom pelo dedo
* Representações
    - Linha
    - Bastão
    - esfera (raio de van der Waals)
    - rastreio de carbono alfa
    - fita
    - Strand
    - tubo factor B
    - Escada de ácido nucleico
    - linha ácido nucleico
    - solventes 'estrelas'
* Coloring
    - por cadeia
    - pela estrutura secundária (quando definidas nos registos FOLHA / HÉLICE)
    - Por Elements
    - Gradação (a.k.a chainbow)
    - fator B
    - polar / apolar
* Cristalografia
    - célula unitária de exibição
    - Mostrar cristal embalagem (quando definido na seção REMARK)
    - Mostra a montagem biológica (quando definidas em secção REMARK)

== Como usar ==

Quando lançado, ESmol carrega automaticamente deoxyhaemoglobin (PDBID: 4HHB) como um exemplo. Você pode girar a molécula por seu dedo.
 
Para ampliar ou traduzir o, botão molécula prima Menu no seu telefone / tablet e selecione o modo. gestos com dois dedos também são suportados.

Para carregar outros arquivos PDB, por favor coloque o arquivo no diretório "APO" do cartão SD e selecione "Abrir" comando no menu. Você também pode baixar estruturas directamente a partir RCSB PDB e servidor web NCBI PubChem. Selecione "Search and Download" no menu.

== Contato ==

site do projecto está localizado na http://webglmol.sourceforge.jp/. Você também pode obter códigos fonte.

Comentários e sugestões são bem-vindos no http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ ou biochem_fan@users.sourceforge.jp

=== === nota de licença

-se ESmol está licenciado sob GNU Lesser General Public License como segue.

No entanto, arquivos PDB incluídos como exemplos estão sob diferentes condições.
Por favor consulte
http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

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ESmol - Visualizador Molecular para Android

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     Este programa é distribuído na esperança de que será útil,
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     Você deve ter recebido uma cópia da GNU Lesser General Public License
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