ESmol -- molecular viewer

ESmol - عارض الجزيئية لالروبوت

تنويه!

إذا كان جهازك يستطيع تشغيل NDKmol، الرجاء استخدامه. وهو أسرع بكثير و
ديك ميزات أكثر من ESmol.
يمكنك الحصول على NDKmol من https://play.google.com/store/apps/details؟id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol.

ويحتفظ ESmol من أجل التوافق مع الأجهزة القديمة جدا.

== معلومات ==

ESmol هو عارض الجزيئي لالروبوت.

يمكنك عرض ثلاثة هياكل ثلاثية الأبعاد للبروتينات والأحماض النووية وجزيئات صغيرة. ESmol يدعم معظم تمثيلات المشتركة للجزيئات، مثل الشريط واقتفاء أثرها، والعصا، ومجال الخط. كما يدعم ESmol عمليات التماثل. يمكن عرض التجمعات البيولوجية والكريستال التعبئة. يمكنك البحث وتحميل الهياكل من RCSB PDB وNCBI بوب كيم.

ESmol ديه تقريبا نفس الوظائف ك GLmol، الذي هو مكتوب في
تقنية WebGL / جافا سكريبت ويعمل على متصفحات الويب. يمكنك محاولة GLmol في http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== == الميزات

* قراءة ملف PDB
   (ESmol لا يمكن فتح الجزيئات الكبيرة (أكثر من 3MB). ولهذا الغرض، يرجى استخدام NDKmol في http://market.android.com/details؟id=jp.sfjp.webglmol.NDKmol)
* اقرأ SDF / ملف MOL
* البحث وتحميل الهياكل من RCSB PDB وNCBI بوب كيم
* تدوير / ترجمة / تكبير نموذج بواسطة الإصبع
* التوكيلات
    - الخط
    - عصا
    - المجال (فان دير فال نصف القطر)
    - أثر الكربون ألفا
    - شريط
    - ساحل
    - أنبوب عامل B
    - سلم الحمض النووي
    - خط الحمض النووي
    - المذيبات "نجوم"
* تلوين
    - عن طريق سلسلة
    - عن طريق هيكل الثانوي (عندما يعرف في سجلات ورقة / HELIX)
    - عن طريق عناصر
    - التدرج (a.k.a chainbow)
    - عامل B
    - القطبي / اقطبي
* البلورات
    - خلية وحدة العرض
    - مشاهدة الكريستال التعبئة (عندما المحددة في الفقرة REMARK)
    - العرض التجمع البيولوجي (عندما المحددة في الفقرة REMARK)

== كيفية استخدام ==

عندما شنت، ESmol تلقائيا بتحميل deoxyhaemoglobin (PDBID: 4HHB) كمثال. يمكنك تدوير جزيء بواسطة إصبعك.
 
لتكبير أو ترجم الجزيء، اضغط على زر MENU في الهاتف / قرص وتحديد وضع. كما يتم دعم بإصبعين الإيماءات.

لتحميل ملفات PDB أخرى، يرجى وضع الملف في "PDB" دليل على بطاقة SD وحدد "فتح" الأوامر في القائمة. يمكنك أيضا تحميل هياكل مباشرة من RCSB PDB وخادم الويب NCBI بوب كيم. اختر "البحث وتحميل" في القائمة.

== == الاتصال

يقع موقع المشروع في http://webglmol.sourceforge.jp/. يمكنك أيضا الحصول على رموز المصدر.

تعليقات واقتراحات هي موضع ترحيب في http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ أو biochem_fan@users.sourceforge.jp

=== إشعار الترخيص ===

مرخص ESmol نفسها تحت رخصة جنو العمومية الصغرى على النحو التالي.

ومع ذلك، شملت ملفات PDB كأمثلة هي في ظل ظروف مختلفة.
من فضلك أطلب الاستشارة
http://www.rcsb.org/pdb/static.do؟p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

----

ESmol - عارض الجزيئية لالروبوت

     (C) حقوق الطبع والنشر 2011، biochem_fan

     هذا البرنامج هو برنامج مجاني: يمكنك إعادة توزيعه و / أو تعديله
     تحت شروط رخصة جنو العمومية والتي نشرتها
     مؤسسة البرمجيات الحرة، سواء الإصدار 3 من الرخصة، أو
     (باختيارك) أي إصدار لاحق.

     يتم توزيع هذا البرنامج على أمل أن يكون مفيدا،
     ولكن بدون أي ضمانات. حتى دون ضمان ضمني
     التسويق أو الملاءمة لغرض معين. رؤية
     رخصة جنو العمومية الصغرى لمزيد من التفاصيل.

     يجب أن كنت قد تلقيت نسخة من رخصة جنو العمومية الصغرى
     جنبا إلى جنب مع هذا البرنامج. إذا لم يكن كذلك، نرى .