마우스 면역 시스템의 다양한 세포 유형에서 유전자 발현 프로파일 탐색

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2023. 7. 3.
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다른 마우스 면역 체계 세포에서 유전자 발현 수준을 탐색합니다. 검색 표시줄에 유전자 이름(또는 별칭)을 입력하여 시작하여 스와이프할 수 있는 적중 목록을 확인합니다.

검색하면 다양한 면역 체계 세포 계통(B 세포, T 세포, 골수 세포 등)에서 해당 유전자의 발현이 얼마나 뜨겁거나 차가운지를 보여주는 "히트맵 바코드"가 표시됩니다. 2개의 서로 다른 플랫폼(RNAseq 및 마이크로어레이)에서 생성된 데이터 세트 사이를 전환합니다.

세포 계보 아이콘을 누르면 막대 차트로 시각화된 동일한 발현 데이터를 볼 수 있습니다. 오른쪽 상단의 설정 메뉴를 사용하여 로그와 선형 축 사이를 전환합니다. 마이크로어레이 데이터에서 낮은 발현 값은 부분적으로 차단됩니다.

기본 "히트맵 바코드" 화면으로 돌아가서 대신 "관련 유전자 표시" 버튼을 누르면 "유전자 배치" 보기가 표시됩니다. 이것은 특정 인구 집단 내에서 가장 상관관계가 높은 유전자를 보여줍니다. 기본적으로 주요 모집단과 관련하여 상관 관계가 표시됩니다. 이들은 전체 면역 체계의 주요 모집단입니다.

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이 데이터는 미국 국립보건원(NIAID)이 지원하는 국제 컨소시엄인 면역 게놈 프로젝트(Immunological Genome Project)에서 생성되었습니다.
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