ImmGen

Jelajahi tingkat ekspresi gen dalam sel sistem kekebalan tikus yang berbeda. Mulailah dengan memasukkan nama gen (atau alias) di bilah pencarian untuk melihat daftar klik yang dapat Anda geser.

Pencarian akan menampilkan "barcode peta panas" yang menunjukkan seberapa panas atau dingin ekspresi gen tersebut melintasi garis keturunan sel sistem kekebalan yang berbeda (sel B, sel T, sel Myeloid, dll). Beralih di antara set data yang dihasilkan pada 2 platform berbeda: RNAseq dan microarray.

Tekan ikon silsilah sel untuk melihat data ekspresi yang sama divisualisasikan sebagai bagan batang. Gunakan menu setelan di kanan atas untuk beralih antara log dan sumbu linier. Dalam data microarray, nilai ekspresi rendah ditutup sebagian.

Kembali ke layar utama "barcode peta panas", jika Anda menekan tombol "Tampilkan gen terkait", Anda akan melihat tampilan "konstelasi gen". Ini menunjukkan gen yang paling berkorelasi dalam kelompok populasi tertentu. Secara default, korelasi ditampilkan sehubungan dengan populasi kunci — ini adalah populasi kunci di seluruh sistem kekebalan tubuh.

Silakan hubungi immgen@gmail.com untuk umpan balik atau permintaan fitur!

Data dihasilkan oleh Proyek Genom Imunologis, sebuah konsorsium internasional yang didukung oleh National Institutes of Health (NIAID).