ImmGen

さまざまなマウス免疫系細胞における遺伝子発現レベルを調べます。まず、検索バーに遺伝子名 (またはエイリアス) を入力して、スワイプできるヒットのリストを表示します。

検索すると、その遺伝子のホットまたはコールド発現がさまざまな免疫系細胞系統 (B 細胞、T 細胞、骨髄細胞など) でどの程度であるかを示す「ヒートマップ バーコード」が表示されます。 RNAseq とマイクロアレイの 2 つの異なるプラットフォームで生成されたデータセットを切り替えます。

細胞系統アイコンを押し下げると、同じ発現データが棒グラフとして視覚化されます。右上の設定メニューを使用して、対数軸と線形軸を切り替えます。マイクロ アレイ データでは、低い発現値が部分的に隠されています。

メインの「ヒートマップ バーコード」画面に戻り、代わりに「関連遺伝子を表示」ボタンを押すと、「遺伝子コンスタレーション」ビューが表示されます。これは、特定の集団グループ内で最も相関する遺伝子を示しています。デフォルトでは、キー集団に関する相関関係が表示されます。これらは、免疫システム全体にわたるキー集団です。

フィードバックや機能のリクエストについては、immgen@gmail.com までご連絡ください。

データは、国立衛生研究所 (NIAID) が支援する国際コンソーシアムである Immunological Genome Project によって生成されます。