ImmGen

Untersuchen Sie die Genexpressionsniveaus in verschiedenen Zellen des Immunsystems der Maus. Geben Sie zunächst einen Gennamen (oder Alias) in die Suchleiste ein, um eine Liste mit Treffern anzuzeigen, durch die Sie wischen können.

Bei der Suche wird ein „Heatmap-Barcode“ angezeigt, der zeigt, wie heiß oder kalt die Expression dieses Gens in verschiedenen Zelllinien des Immunsystems (B-Zellen, T-Zellen, myeloische Zellen usw.) ist. Wechseln Sie zwischen Datensätzen, die auf 2 verschiedenen Plattformen generiert wurden: RNAseq und Microarray.

Drücken Sie auf ein Zellabstammungssymbol, um dieselben Ausdrucksdaten als Balkendiagramm anzuzeigen. Verwenden Sie das Einstellungsmenü oben rechts, um zwischen einer logarithmischen und einer linearen Achse umzuschalten. In den Microarray-Daten sind niedrige Expressionswerte teilweise verdeckt.

Zurück auf dem Hauptbildschirm "Heatmap-Barcode", wenn Sie stattdessen auf die Schaltfläche "Verwandte Gene anzeigen" klicken, sehen Sie eine Ansicht "Genkonstellation". Dies zeigt seine am stärksten korrelierten Gene innerhalb bestimmter Bevölkerungsgruppen. Standardmäßig wird die Korrelation in Bezug auf Schlüsselpopulationen angezeigt – dies sind Schlüsselpopulationen im gesamten Immunsystem.

Bitte wenden Sie sich für Feedback oder Funktionsanfragen an immgen@gmail.com!

Die Daten werden vom Immunological Genome Project generiert, einem internationalen Konsortium, das von den National Institutes of Health (NIAID) unterstützt wird.