ImmGen

Esplora i livelli di espressione genica in diverse cellule del sistema immunitario del topo. Inizia inserendo il nome di un gene (o alias) nella barra di ricerca per visualizzare un elenco di risultati che puoi scorrere.

La ricerca visualizzerà un "codice a barre heatmap" che mostra quanto sia calda o fredda l'espressione di quel gene attraverso diversi lignaggi cellulari del sistema immunitario (cellule B, cellule T, cellule mieloidi, ecc.). Alterna i set di dati generati su 2 diverse piattaforme: RNAseq e microarray.

Premi l'icona di un lignaggio cellulare per vedere gli stessi dati di espressione visualizzati come un grafico a barre. Utilizza il menu delle impostazioni in alto a destra per passare da un asse lineare a un asse lineare. Nei dati di microarray, i valori di espressione bassi sono parzialmente occlusi.

Tornando alla schermata principale "codice a barre heatmap", se invece premi il pulsante "Mostra geni correlati", vedrai una vista "costellazione genica". Questo mostra i suoi geni più correlati all'interno di determinati gruppi di popolazione. Per impostazione predefinita, viene mostrata la correlazione rispetto alle popolazioni chiave: si tratta di popolazioni chiave dell'intero sistema immunitario.

Si prega di contattare immgen@gmail.com per feedback o richieste di funzionalità!

I dati sono generati dall'Immunological Genome Project, un consorzio internazionale sostenuto dal National Institutes of Health (NIAID).