A Federação Médica de Entre Ríos tem como área de atuação o território da província de Entre Ríos. Consequentemente, é constituído por todas as entidades sindicais médicas departamentais organizadas de forma semelhante, existentes em todo o território. Entre outras, a missão institucional do Femer é:
- Reunir e representar todas as entidades médicas sindicais departamentais.
- Exercer a representação e defesa dos interesses profissionais dos médicos perante o Estado Nacional, a Província, os Municípios e instituições públicas e privadas de todo o tipo.