La Fédération médicale d'Entre Ríos a pour zone d'action le territoire de la province d'Entre Ríos. En conséquence, il est composé de toutes les entités syndicales médicales départementales organisées de manière similaire, existant sur l'ensemble du territoire. Entre autres, la mission institutionnelle de Femer est :
- Regrouper au sein et représenter toutes les entités médicales syndicales départementales.
- Exercer la représentation et la défense des intérêts professionnels des médecins auprès de l'Etat National, de la Province, des communes et des établissements publics et privés de toute nature.