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जैसा कि युद्ध जारी रहा, शहीद को सेवाएं प्रदान करने की प्रक्रिया जारी रही, इस प्रकार 1990 में प्राधिकरण को पेंशन के सामान्य निदेशालय से अलग कर दिया गया और शहीदों के लिए एक स्वतंत्र निदेशालय के रूप में संचालन शुरू कर दिया और उप-राष्ट्रपति के कार्यालय के तहत अक्षम कर दिया गया। बाद में, अप्रैल 1992 में बहादुर अफगान लोगों के पवित्र जिहाद को श्रद्धांजलि अर्पित करने के प्रयास में प्राधिकरण को एक मंत्रालय का दर्जा दिया गया, जिसने शहीदों के पंजीकरण और देश भर में शहीदों और पीडि़तों की अक्षम संबोधन के साथ काम करना शुरू कर दिया। 1996 में तालिबान युग के दौरान, निदेशालय को शरणार्थी और रिटर्न मंत्रालय में मिला दिया गया था, जहां यह उप मंत्रालय के रूप में कार्य करता रहा। 2002 में, संक्रमण काल के दौरान निदेशालय को एक बार फिर "शहीदों और विकलांग मंत्रालय" नामक मंत्रालय की स्थिति में पदोन्नत किया गया था। 2006 में, मंत्रालय को श्रम और सामाजिक मामलों के मंत्रालय में मिला दिया गया था और सामूहिक रूप से श्रम मंत्रालय, सामाजिक मामलों, शहीदों और विकलांगों को "MoLSAMD" कहा जाता था। मंत्रालय के तहत, शहीदों से संबंधित मामलों और विकलांग लोगों को एक उप मंत्रालय के माध्यम से प्रबंधित किया गया था।
07 अक्टूबर 2019 को, उप मंत्रालय को MoLSAMD से अलग कर दिया गया था और धारावाहिक संख्या 75 के साथ जारी किए गए एक राष्ट्रपति डिक्री के माध्यम से शहीदों और विकलांग लोगों के लिए राष्ट्रीय सहायता प्राधिकरण बन गया। प्राधिकरण ने लोगों की सेवा करने के उद्देश्य से अधिनियमित राष्ट्रीय कानूनों के आलोक में काम करना शुरू कर दिया। अपने जीवन को त्याग दिया है या परिवार के सदस्यों को खो दिया है।
इसके बाद, अधिकार को 19 जनवरी 2019 को क्रम संख्या 132 के साथ जारी एक अध्यक्षीय डिक्री के माध्यम से शहीद और विकलांग मामलों के लिए राज्य मंत्रालय में पदोन्नत किया गया था और वर्तमान में कार्यात्मक है।