Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer

* Im Einklang mit Änderungen des Android-Betriebssystems greifen Sie bitte mit dem ES File Explorer auf lokale Dateien zu, die die Laufwerke / SD-Karten rooten. Sie müssen zum ES File Explorer gehen, um zuerst das Rooten durchzuführen. Bitte beachten Sie, dass die Dropbox-Unterstützung aufgrund von Änderungen in Android und Dropbox entfernt wird.

Dies ist die erste Android-App, mit der Sie Gel- (sowohl Agarose- als auch PAGE-) Bänder mit einem Loggraphen analysieren können, der automatisch aus den Markern generiert wird. Es ermöglicht die automatische Erkennung und das Laden für zukünftige Anwendungen. Mit Gabor-Filter ermöglicht diese App Benutzern, die Erkennung von Bändern automatisch zu verbessern. Bei Bildern mit schlechter Qualität können Benutzer klicken, um eine Box manuell auf das gewünschte Band zu zeichnen, oder auf das Bild klicken, um den angegebenen Ort zu bestimmen.

Bilder können aus Galerie oder Dropbox geladen werden, was es sehr praktisch macht. Die besten Bilder werden mit Scannern erstellt, funktionieren aber mit gut aufgenommenen Fotos von den mobilen Kameras.

Fotos sollten auf einer direkten Ebene mit dem Gel gemacht werden.

Funktionen dieser App umfassen:

1) Spezifikation von Agarose oder PAGE.
2) Farbidentifizierung der Markierungsbänder für PAGE.
3) Erweiterte Bildgebungsfilter - Garbor.
4) Automatisierte Bildverarbeitung mit benutzerdefinierten Benutzereingaben, falls erforderlich.
5) Speichern von Einstellungen für die Bildverarbeitung für zukünftige Bequemlichkeit.
6) Speichern von Markern für zukünftige Bequemlichkeit bei Verwendung der gleichen Marker.
7) Einfache und knopfbasierte Benutzeroberfläche.
8) Automatische Erkennung von Bändern.
9) Einfaches benutzerdefiniertes Begrenzungsfeld.
10) Log-Graph des automatisch erzeugten Markers.
11) Benutzerdefinierter Ort bestimmter Bänder.
12) Kompatibilität mit Quer- und Hochformat von Tablets und Smartphones in mehreren Größen.
13) Kompatibilität mit Screenshot-Funktionen von analysierten Gel- und Log-Graph-Smartphones und Tablets für Veröffentlichungen oder Berichte.
14) Messwerte im Gelbild mit hervorgehobenen Kästchen und berechneter Bandgröße.
15) Beschneidungsfunktion für Bilder vor der Analyse.
16) Bearbeiten Sie die Funktion, um unerwünschte Bänder zu entfernen.
17) Verschiedene farbige Kästchen für Marker und Bänder.
18) Einfacher direkter Zugriff auf Bildergalerie für Bilder.
19) Kompatibel mit Sybr Green, EtBr-Agarosegel-Analyse.
20) Direkter Kamerazugriff.


Vorteile der Verwendung dieser App für Publikationen
1) Bringt mehr Genauigkeit in Ihre Gelanalyse anstatt sich auf Näherungen zu verlassen.
2) Wertschöpfung zu Publikationen und Berichten.
3) Nützliches Lehrmittel für Studenten der Naturwissenschaften.
4) Optimierte Analyse, Verringerung von menschlichem Versagen und Subjektivität - Sie können jetzt den Werten vertrauen, die von Praktikanten und weniger erfahrenem Personal berichtet werden!
5) Unterwegs Analyse mit dem Smartphone / Tablet.
6) Automatische Analyse - keine Notwendigkeit für Millimeterpapier und mühsames Plotten.
7) Die App ist KOSTENLOS!
8) Die App ist in sich abgeschlossen, kein Internetzugang erforderlich (außer für Dropbox-Analyse).

Android 6-Nutzer können Bilder von der lokalen "Image" -Galerie abrufen. Frühere Benutzer der Android-Version werden DropBox unterstützen. Dies ist auf Änderungen in Android 6 zurückzuführen und liegt außerhalb unserer Kontrolle.

Anweisungen zur Verwendung finden Sie unter https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be

Userguide als pdf verfügbar unter http://tinyurl.com/GelApp

* Neueste Telefone, z.B. Samsung Note 8 kann Probleme beim Speichern der Kamera haben. Wenn solche Probleme auftreten, verwenden Sie die Galerie.

Um zu zitieren, benutzen Sie bitte:

Sim, JZ. *, Nguyen, PV. *, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: Mobiler Gelelektrophorese-Analysator. Nature Methods Anwendungshinweise. doi: 10.1038 / an9643

ODER zur Software direkt im App Store

Sim, J. Z., Nguyen, P. V., Gan, S. K. E. (2014) GelApp: DNA & Prot Gel Analyzer v1.2. [Mobile Anwendungssoftware]. Von https://play.google.com abgerufen


Diese App ist ein Produkt des Labors für Antikörper- und Produktentwicklung, Abteilung für Translationale Forschung, Bioinformatik-Institut, Agentur für Wissenschaft, Technologie und Forschung, Singapur.
Die Autoren sind: Herr SIM Jia Zhi, Herr NGUYEN Phi Vu und Dr. Samuel GAN.
                    (Poly intern) (Forschungsbeauftragter) (Stellvertretender Projektleiter)